O programa foi pensado inicialmente como um projeto, criado através de uma parceria entre três secretarias municipais da cidade de São Paulo: a Secretaria da Saúde, a Secretaria do Verde e do Meio Ambiente e a Secretaria da Assistência e Desenvolvimento Social. Além disso, contou com a participação de diversas instituições e órgãos governamentais, dentre os quais, o Ministério da Saúde e o PNUMA – Programa das Nações Unidas para o Meio Ambiente. O caráter intersecretarial de sua criação teve por base a forte ligação entre a promoção de práticas ecologicamente corretas e a manutenção da saúde pública.

        No período compreendido entre março e julho de 2007, foi realizada uma capacitação coletiva dos cerca de cinco mil Agentes Comunitários de Saúde do Programa Saúde da Família, no intuito de possibilitar sua atuação como agentes de divulgação e idealizadores de projetos no entorno de suas respectivas UBSs. Os agentes tiveram aulas uma vez por semana ao longo dos 5 meses, com educadores contratados pelos 12 parceiros da SMS, totalizando 128 horas de capacitação. Os ACSs têm hoje autonomia para sugerir a criação de projetos que satisfaçam as demandas de sua região. Essa característica bastante peculiar do programa torna o atendimento mais dinamizado, facilitando o acesso dos gestores às necessidades e carências da população atendida.

        Em 2008, ainda como um projeto, o PAVS desenvolveu diversas atividades em todas as UBSs onde atuava, desde a criação de áreas de lazer e hortas comunitárias até a realização de oficinas de música e luteria. Tendo em vista a diversidade e relevância do trabalho realizado, no ano de 2009 o projeto adquiriu um novo status, de programa e política pública, além de ter sido incorporado pela SMS. Atualmente, a equipe do programa atuante em UBSs gerenciadas pela ASF engloba quatro gestores regionais (regiões norte, sul, sudeste e centro-oeste da capital), nove gestores locais e profissionais de um novo cargo, denominado APA – Agente de Promoção Ambiental – que representa o programa em cada unidade individualmente.